Use this url to cite publication: https://hdl.handle.net/20.500.12512/112295
Options
Plazmos laisvai cirkuliuojančios DNR analizė: mutantinio alelio dažnio dinamika skrandžio vėžio ligos eigoje / Greta Varkalaitė, Micheal Forster, Juozas Kupčinskas, Jurgita Skiecevičienė
Type of publication
Konferencijų tezės nerecenzuojamame leidinyje / Conference theses in non-peer-reviewed publication (T2)
Author(s)
Forster, Michael | ||
Title
Plazmos laisvai cirkuliuojančios DNR analizė: mutantinio alelio dažnio dinamika skrandžio vėžio ligos eigoje / Greta Varkalaitė, Micheal Forster, Juozas Kupčinskas, Jurgita Skiecevičienė
Publisher (trusted)
Lietuvos mokslų akademija |
Date Issued
Date Issued |
---|
2021-11-25 |
Extent
p. 39-39.
Is part of
14-oji Lietuvos jaunųjų mokslininkų konferencija BIOATEITIS: gamtos ir gyvybės mokslų perspektyvos : pranešimų santraukos : 2021 m. lapkričio 25 d., Kaunas / Lietuvos mokslų akademijos Biologijos, medicinos ir geomokslų skyrius. Lietuvos sveikatos mokslų universitetas ; [Leidinį sudarė Jadvyga Olechnovičienė ir Vaidutis Kučinskas]. Vilnius : Lietuvos mokslų akademija, 2021. ISBN 9789986080855.
Version
Originalus / Original
Description
Medicinos ir sveikatos mokslų sekcija. Sveikatos mokslai
ISBN 978-9986-08-085-5 Skaitmeninis (PDF) ISBN 978-9986-08-086-2
Bibliogr.: p. 39
Field of Science
Abstract
Skystoji biopsija – navikinės medžiagos (ląstelių ar nukleorūgščių), gautos minimaliai invaziniu ar visiškai neinvaziniu būdu iš kraujo ar kitų kūno skysčių, analizė. Nors laisvai cirkuliuojanti navikinė medžiaga gali būti aptinkama įvairiuose kūno skysčiuose, tačiau kraujo tyrimai vis dar išlieka vienu patogiausių ir prieinamiausių pacientui ir medicinos personalui. Skrandžio vėžys (SV) yra ketvirtas pagal dažnumą vėžinis susirgimas pasaulyje (1). Pastarojo meto skystosios biopsijos tyrimai atskleidžia šių biožymenų panaudojimo galimybes beveik bet kurioje navikinio proceso stadijoje: ligos stadijos, progreso įvertinimas, naviko genomo ar specifinių genominių mutacijų nustatymas. Tyrimo tikslas – palyginti laisvai cirkuliuojančios DNR (lcDNR) mutacijų profilius ir mutantinio alelio dažnio pokyčius SV ligos eigoje. Kraujo mėginiai buvo surinkti Gastroenterologijos klinikoje, LSMU Kauno klinikose, pacientams i) prieš operaciją ir gydymą, ii) iš karto po operacijos ir iii) kontrolinio apsilankymo metu (iš viso 46 plazmos mėginiai). Genų panelė buvo sudaryta iš 15 genų, labiausiai mutavusių anksčiau atliktoje mūsų studijoje (Varkalaite, G. et. al. 2021) ir įtraukti į The Cancer Gene Consensus katalogą. Naujos kartos sekoskaitos bibliotekos paruoštos naudojant komercinius rinkinius pritaikytus lcDNR fragmentų žymėjimui unikaliais molekuliniais identifikatoriais (angl. Unique molecular identifiers), leidžiančiais tiksliau kokybiškai ir kiekybiškai įvertinti genetinius variantus, ir nuskaitytos panaudojant NovaSeq 6000 platformą (Illumina). Iš viso somatinės unikalios panelės genų mutacijos buvo nustatytos 12 iš 17 (70,6 %) SV pacientų plazmos lcDNR. Didžioji dalis nustatytų variantų buvo klaidingos prasmės mutacijos (89,1 %), likusios – stop kodono, introninės ir trikdančios delecijos be rėmelio poslinkio (10,9 %) Analizuojant minėtuose laiko taškuose pasikartojančius somatinius variantus nustatyta, kad 8 iš 12 (66,7 %) pacientų buvo nustatytos tos pačios genų mutacijos (nuo 2 iki 4 somatinių variantų) bent dviejuose laiko taškuose. Trims iš 4 (75 %) naviko atsinaujinimo atvejų buvo nustatytos dar prieš operaciją aptiktos somatinės mutacijos. Mūsų rezultatai rodo, kad somatinės mutacijos gali būti nustatomos SV pacientų plazmos lcDNR, taip pat ir skirtinguose ligos eigos etapuose. Šis molekulinis žymuo gali turėti svarbią praktinę naudą, neinvaziniu būdu padėti apibūdinti molekulinį naviko profilį, o taip pat galėtų būti pritaikomas neinvazinei pacientų diagnostikai, ligos eigos stebėjimui ar prognozės įvertinimui.
Type of document
type::text::conference output::conference proceedings::conference paper
ISBN (of the container)
9789986080855
9789986080862
Other Identifier(s)
(LSMU ALMA)990001048720107106
Coverage Spatial
Lietuva / Lithuania (LT)
Language
Lietuvių / Lithuanian (lt)
Bibliographic Details
1