Use this url to cite publication: https://hdl.handle.net/20.500.12512/112285
Options
Opinio kolito žarnyno epitelinių lastelių mikroRNR dalyvauja uždegiminių procesų reguliacijoje / Rūta Inčiūraitė, Simonas Juzėnas, Indrė Dalgėdienė, Rima Ramonaitė, Gediminas Kiudelis, Laimas Virginijus Jonaitis, Juozas Kupčinskas, Aurelija Žvirblienė, Jurgita Skiecevičienė
Type of publication
Konferencijų tezės nerecenzuojamame leidinyje / Conference theses in non-peer-reviewed publication (T2)
Author(s)
Dalgėdienė, Indrė | ||
Žvirblienė, Aurelija | ||
Title
Opinio kolito žarnyno epitelinių lastelių mikroRNR dalyvauja uždegiminių procesų reguliacijoje / Rūta Inčiūraitė, Simonas Juzėnas, Indrė Dalgėdienė, Rima Ramonaitė, Gediminas Kiudelis, Laimas Virginijus Jonaitis, Juozas Kupčinskas, Aurelija Žvirblienė, Jurgita Skiecevičienė
Publisher (trusted)
Lietuvos mokslų akademija |
Date Issued
Date Issued |
---|
2021-11-25 |
Extent
p. 23-23.
Is part of
14-oji Lietuvos jaunųjų mokslininkų konferencija BIOATEITIS: gamtos ir gyvybės mokslų perspektyvos : pranešimų santraukos : 2021 m. lapkričio 25 d., Kaunas / Lietuvos mokslų akademijos Biologijos, medicinos ir geomokslų skyrius. Lietuvos sveikatos mokslų universitetas ; [Leidinį sudarė Jadvyga Olechnovičienė ir Vaidutis Kučinskas]. Vilnius : Lietuvos mokslų akademija, 2021. ISBN 9789986080855.
Version
Originalus / Original
Description
Medicinos ir sveikatos mokslų sekcija. Medicina
ISBN 978-9986-08-085-5 Skaitmeninis (PDF) ISBN 978-9986-08-086-2
Field of Science
Abstract
Opinis kolitas (OpK) – lėtinė, atsinaujinanti uždegiminė liga, pažeidžianti storosios žarnos gleivinę, o vienas dažniausių jos bruožų – pirminio epitelinio barjero pažeidimas. Siekiant suprasti biologinę mikroRNR (miRNR) raiškos prasmę audinio lygmenyje, svarbu įvertinti miRNR signalus ląsteliniame lygmenyje, kadangi kiekvienas ląstelių tipas pasižymi jam unikalia epigenetinių žymenų raiška. Šio tyrimo tikslas buvo nustatyti pakitusios raiškos miRNR storosios žarnos audinyje bei kriptų viršuje ir apačioje esančių epitelinių ląstelių populiacijose aktyvaus ir neaktyvaus OpK metu. Buvo analizuojamos dvi nepriklausomos tiriamųjų grupės: pirmojoje ir antrojoje atitinkamai surinkti 23 ir 16 sergančiųjų aktyviu OpK, 20 ir 15 esančiųjų OpK remisijoje bei 33 ir 17 kontrolinės grupės asmenų storosios žarnos biopsijų mėginiai. Iš antrosios grupės mėginių buvo išrūšiuotos storosios žarnos kriptų viršuje ir apačioje esančių epitelinių ląstelių populiacijos. Iš abiejų grupių mėginių buvo išgryninta visuminė RNR ir atlikta naujos kartos sekoskaita. Gauti sekoskaitos duomenys buvo apdoroti bioinformatiniais įrankiais: nextflow-core/smrnaseq analizės algoritmas, Rstudio programinė įranga su DESeq2, multimiR, ReactomePA, ggplot2 ir kt. paketais. MiRNR raiška buvo laikoma statistiškai reikšmingai pakitusia, kai koreguota p vertė < 0,05, o |log2PK| > 1. Storosios žarnos audiniuose nustatytos 563 unikalios miRNR. 95 ir 82 miRNR buvo pakitusios raiškos aktyvaus OpK metu, palyginti atitinkamai su kontroline grupe ir OpK remisija. 35 miRNR buvo dereguliuotos OpK remisijos metu, palyginti su kontroline grupe. GSEA atskleidė, kad pakitusios raiškos audinių miRNR dalyvauja signalo perdavime per interleukinus, IL-4 ir IL-13, TLR4, kt. Storosios žarnos kriptų viršuje ir apačioje esančių epitelinių ląstelių populiacijose identifikuotos 432 unikalios
miRNR. Kaip ir storosios žarnos audiniuose, ląstelių populiacijose nustatytas laipsniškai didėjantis pakitusios raiškos miRNR skaičius priklausomai nuo uždegimo aktyvumo. Taip pat nustatyta, kad aktyvaus OpK metu tarp kriptų viršuje ir apačioje esančių ląstelių skiriasi 5, OpK remisijos metu – 2 miRNR raiška. GSEA atskleidė, kad dereguliuotos epitelinių ląstelių populiacijų miRNR dalyvauja tokiuose procesuose kaip signalo perdavimas per interleukinus, IL-4 ir IL-13, TLR4, tirozino kinazių receptorius, kt. Taip pat nustatytos 16 kriptų viršuje esančių ląstelių ir 14 - apačioje esančių ląstelių miRNR, kurių raiška vidutiniškai koreliuoja su endoskopiniu Mayo balu. Apibendrinant, šis tyrimas leido (i) identifikuoti OpK metu storosios žarnos audiniuose ir kriptų viršuje bei apačioje esančiose epitelinėse ląstelėse pakitusios raiškos miRNR ir (ii) nustatyti, kokiuose su uždegimu susijusiuose signaliniuose keliuose jos dalyvauja.
Type of document
type::text::conference output::conference proceedings::conference paper
ISBN (of the container)
9789986080855
9789986080862
Other Identifier(s)
(LSMU ALMA)990001048630107106
Coverage Spatial
Lietuva / Lithuania (LT)
Language
Lietuvių / Lithuanian (lt)
Funding(s)
Funding(s) | Grant No | Project ID |
---|---|---|
Lietuvos mokslų taryba | Nr. S-MIP-20-56 | |
Europos Krono ir Kolito organizacija | ECCO Grant 2016 |