Use this url to cite ETD: https://hdl.handle.net/20.500.12512/107468
Options
Hepatito C viremija ir genotipų dažnis tiriamųjų populiacijoje
Type of publication
type::text::thesis::master thesis
Title
Hepatito C viremija ir genotipų dažnis tiriamųjų populiacijoje
Other Title
Hepatitis C viremia and genotype frequency in the study population
Author
Dovydaitytė, Eglė |
Advisor
Other(s)
Recenzentas / Reviewer | |
Eidukaitė, Audronė | Komisijos pirmininkas / Committee Chairman |
Komisijos narys / Committee Member | |
Komisijos narys / Committee Member | |
Komisijos narys / Committee Member | |
Komisijos narys / Committee Member | |
Komisijos narys / Committee Member |
Extent
50 p.
Date Issued
2020
Abstract
Magistro darbo autorius: Eglė Dovydaitytė Magistro darbo pavadinimas: Hepatito C viremija ir genotipų dažnis tiriamųjų populiacijoje. Darbo tikslas: įvertinti hepatito C viremiją ir genotipų dažnį tiriamųjų populiacijoje. Tyrimo uždaviniai: 1. Nustatyti hepatito C viremiją tiriamųjų populiacijoje. 2. Nustatyti hepatito C genotipų dažnį tiriamųjų populiacijoje. 3. Įvertinti hepatito C viremiją ir genotipų dažnį tiriamųjų populiacijoje atsižvelgiant į tiriamųjų lytį ir amžių. Tyrimo objektas ir metodai. Retrospektyviai analizuoti 2018 metais LSMU Laboratorinės medicinos klinikoje dėl hepatito C tirtų pacientų duomenys. Atrinkti pacientai su nustatyta HCV viremija ir genotipu. HCV viremijai nukleorūgščių amplifikacijos metodu aptikti buvo naudojami „artus HCV QS-RGQ Kit“ (QIAGEN, Vokietija) reagentų rinkiniai, „QIAsymphony® AS/SP“ (QIAGEN, Vokietija) analizatoriai ir „Rotor Gene® Q“ (QIAGEN, Vokietija) termocikleris. Genotipo nustatymui naudoti „GeneAmp® PCR System 9700“ (Applied Biosystems, JAV) termocikleris ir „VERSANT® HCV Amplification 2.0 Kit (LiPA)“ (Siemens Healthineers, Vokietija) reagentų rinkiniai. Rezultatai. Iš 200 tiriamųjų, 59 proc. sudarė vyrai ir 41 proc. moterys. Vyriausias pacientas buvo 86 metų, jauniausias – 22 metų amžiaus, o populiacijos amžiaus vidurkis buvo 51,4 metai. Tiriamųjų populiacijoje vyravo (77,5 proc.) didelę (>6,0×105 TV/ml) viremiją turintys pacientai. Dažniausiai (63,5 proc.) aptinkamas buvo 1 genotipas, rečiau (30 proc.) 3 genotipas, o rečiausiai (6,5 proc.) – 2 genotipas. Tarp 1 ir 3 genotipus turinčių pacientų reikšmingai (p=0,008 ir p=0,016) daugiau nustatyta didelės viremijos atvejų. Pirminės viremijos vidurkis buvo didesnis (p=0,026) vyrų grupėje, o tarp amžiaus grupių statistiškai reikšmingai nesiskyrė. 3 genotipą turintys tiriamieji buvo statistiškai reikšmingai (p=0,011) jaunesni nei turintys kitus genotipus. Išvados: 1. Nustatytas pirminės viremijos vidurkis tiriamųjų populiacijoje – 6,9×106±1,1×107 TV/ml. 55 proc. daugiau tiriamųjų turėjo didelę viremiją. 2. Tiriamųjų populiacijoje 63,5 proc. nustatyta HCV 1 genotipų, perpus mažiau – 3 genotipų, mažiausiai – 2 genotipų. Dažniausi HCV genotipai/subtipai buvo 1b, apimantis daugiau nei trečdalį populiacijos, 3a, 1a/1b, 1, o rečiausi buvo 2a/2c, 1a, 2b ir 2. 3. Statistiškai reikšmingai didesnis pirminės viremijos vidurkis nustatytas vyrams, nepriklausomai nuo amžiaus. Tiriamųjų populiacijoje nustatytų HCV genotipų/subtipų dažnis skyrėsi priklausomai nuo lyties (daugiau 1 genotipo vyrų, 1b subtipo moterų). Genotipų dažnių pasiskirstymas priklausė nuo amžiaus grupių, 3 genotipas buvo nustatomas jaunesniems tiriamiesiems.
Author of a master‘s thesis. Eglė Dovydaitytė The title of the master‘s thesis. Hepatitis C Viremia and Genotype Frequency in the Study Population. The aim: to evaluate hepatitis C viremia and genotype frequency in the study population. Objectives: 1. To determine hepatitis C viremia in the study population. 2. To determine hepatitis C genotype frequency in the study population. 3. To evaluate hepatitis C viremia and genotype frequency in the study population in relation to gender and age of subjects. Study subjects and methods: Retrospectively analyzed data from patients tested for hepatitis C at Clinic of Laboratory Medicine of Lithuanian University of Health Sciences (LSMU). Patients with detected HCV viremia and genotype were selected. „artus HCV QS-RGQ Kit“ (QIAGEN, Germany) reagent kits, „QIAsymphony® AS/SP“ (QIAGEN, Germany) analyzers and „Rotor Gene® Q“ (QIAGEN, Germany) thermocycler were used to detect HCV viremia by nucleic acid amplification. „GeneAmp® PCR System 9700“ (Applied Biosystems, USA) thermocycler and „VERSANT® HCV Amplification 2.0 Kit (LiPA)“ (Siemens Healthineers, Germany) reagent kits were used for genotyping. Results: Of the 200 subjects, 59% were men and 41 % women. The oldest patient was 86 years, the youngest 22 yearsold , and the mean of population age was 51.4 years. In the study population high viraemia (>6,0×105 IU/ml) was predominant (77.5%). Genotype 1 was the most common (63.5%), genotype 3 was less frequent (30%), and genotype 2 was the rarest (6.5%). Significantly (p=0.008 and p=0.016) more cases of primary viremia were observed among patients with genotypes 1 and 3. The mean primary viremia was higher (p=0.026) in the male group and did not differ statistically significantly between age groups. Subjects with genotype 3 were statistically significantly (p=0.011) younger than those with other genotypes. Conclusions: 1. The mean most popular primary viremia was 6.9×106±1.1×107 IU/ml. 55 % more subjects with large viremias. 2. In the study population 63,5 % were HCV 1 genotype, half less 3 genotype, at least 2 genotype. The most HCV genotypes/subtypes were 1b, covering more than a third of the population, 3a, 1a/1b, 1, and the rarest were 2a/2c, 1a, 2b and 2. 3. There is a statistically significant increase in mean primary viremia in men regardless of age. The frequency of HCV genotypes/subtypes identified in the study population differ by gender (more 1 genotype were male, 1b subtype - female). Difference of genotype frequency depend on age groups, 3 genotypes were identified in younger subjects.
Publisher
Lietuvos sveikatos mokslų universitetas
Other Identifier(s)
id-60202422
Language
Lietuvių / Lithuanian (lt)
Defended
Taip / Yes
Access Rights
Atviroji prieiga / Open Access