Virškinimo sistemos tyrimų institutas

  • Apie institutą

    LSMU Virškinimo sistemos tyrimų institutas
    Adresas: Eivenių 4, 50161 Kaunas
    Tel. (8 37) 326092
    El.paštas: virskinimas@lsmuni.lt
    Kontaktai

    2011 metais LSMU Senato sprendimu įsteigtas  LSMU MA MF Virškinimo sistemos tyrimo institutas (vadovas -Lietuvos mokslų akademijos tikrasis narys, prof. habil. dr. Limas Kupčinskas). Institute  veikia  dvi laboratorijos:  Klinikinės ir molekulinės gastroenterologijos  (vadovė - dr. Jurgita Skiecevičienė) bei Chirurginės gastroenterologijos (vadovas – prof. dr. Antanas Gulbinas).

     

     

  • Veiklos tikslai

    Pagrindiniai Virškinimo sistemos tyrimo instituto veiklos tikslai:

    • vykdyti šiuolaikinius fundamentalius ir klinikinius virškinimo sistemos ir kepenų ligų  mokslinius tyrimus; gausinti ir skleisti mokslo žinias ir patirtį žmogaus virškinimo sistemos funkcionavimo, ligų  gydymo, profilaktikos ir kontrolės bei gyvenimo kokybės (gerovės) užtikrinimo srityse;
    • rengti mokslininkus bei dalyvauti LSMU, Lietuvos ir tarptautinėse mokslo programose;
    • efektyviai panaudoti mokslinių tyrimų duomenis sveikatos sistemoje ir studijų procese;
  • Instituto istorija

    2000 m. prie Kauno medicinos universiteto (KMU)  Gastroenterologijos klinikos buvo įkurta KMU Gastroenterologijos klinikos Mokslininkų grupė, kuri 2008 m. KMU Senato sprendimu buvo reorganizuota į Gastroenterologijos ir hepatologijos mokslinę laboratoriją (vadovas prof. L. Kupčinskas).  2004  m. KMU Biomedicinos mokslų tyrimo institute buvo įkurta Chirurginės gastroenterologijos laboratorija (vadovas dr. A.Gulbinas). Abi šios laboratorijos sėkmingai vykdė fundamentalius ir klinikinius virškinimo sistemos ligų mokslinius tyrimus, todėl  2011 m. LSMU Senato sprendimu,  jas apjungus, buvo įkurtas  LSMU MA MF  Virškinimo sistemos tyrimų institutas,  kurio sudėtyje šiuo metu veikia  dvi laboratorijos  - Klinikinės ir molekulinės gastroenterologijos  bei  Chirurginės gastroenterologijos.  

  • Klinikinės ir molekulinės gastroenterologijos laboratorija

    Laboratorijos vedėja  dr. Jurgita Skiecevičienė

     

     

     

     

     

     

     

    Tel. (8 37) 326092
    El. paštas: j.sventoraityte@gmail.com

    Klinikinės ir molekulinės gastroenterologijos laboratorijos pagrindinės mokslinių tyrimų kryptys:

    • uždegiminių žarnyno ligų  (opinio kolito ir Krono ligos)  epidemiologiniai, genetiniai, genominiai,  klinikiniai tyrimai;
    • susijusių su H. pylori infekcija ligų - gastrito, opaligės, skrandžio vėžio epidemiologiniai, mikrobiologiniai,  genetiniai,  klinikiniai tyrimai;
    • retų virškinamojo trakto ir kepenų ligų (Vilsono ligos, hemochromatozės, Budd-Chiari sindromo ir kitų retų ligų)  klinikiniai ir genetiniai tyrimai;
    • ikinavikinų  ir navikinių virškinamojo trakto ligų  patogenezės tyrimai;
    • žmogaus žarnyno mikrobiomo tyrimai, dvynių  mikrobiomo tyrimai.

    Laboratorijoje dirba genetikai,  molekuliniai biologai ir klinicistai-gastroenterologai, kurių aukštą kvalifikaciją atspindi 2002-2013 m. atspausdinti daugiau kaip 140 mokslinių straipsnių (iš jų daugiau  kaip 60 ISI WoS duomenų bazės žurnaluose su svorio koeficientu) , tarp jų - Nature (2012; IF-36,3), Nature Genetics (2009, 2010, 2011; IF-36), Gastroenterology (2005, 2011, 2013; IF-12); Gut (2006, 2013, 2013; IF-10), Inflamatory bowel diseases(2013; IF 5,5),  Physiological Genomics (2009) ir kt. žurnaluose.  Šie straipsniai daugiau buvo kaip 1600 kartų cituoti WoS duomenų bazės žurnaluose (laboratorijos mokslininkų  bendras mokslinių straipsnių citavimo h-indeksas - 17). 

    Laboratorija aprūpinta  naujausia įranga reikalinga atlikti molekuliniams- genetiniams tyrimams. Labaratorija glaudžiai bendradarbiauja su LSMU Gastroenterologijos klinika ir yra jos funkcinis mokslo  padalinys.

  • Klinikinės ir molekulinės gastroenterologijos laboratorijos moksliniai projektai

    1. „Mikro-RNR kaip biožymenys ankstyvajai ikivėžinių ir vėžinių virškinamojo trakto ligų diagnostikai“. Finansavimo šaltinis: LMT ir ES lėšos pagal 2011-2014 m. Žmogiškųjų išteklių plėtros veiksmų programą. Sąmatinė vertė: 1.411.580 Lt.

    2. „Žarnyno mikrobiotos reikšmė vaikų uždegiminių žarnų ligų patogenezei“ Finansavimo šaltinis: Lietuvos mokslo taryba. Sąmatinė vertė: 174.500 Lt

    3. “Trichuris trichuria sukeliamas imuninis atsakas ir jo sąsaja su uždegiminių žarnų ligų etiopatogeneze" Finansavimo šaltinis: Lietuvos valstybinis mokslo ir studijų fondas. Sąmatinė vertė: 40,000 Lt. Terminai: 2006.

    4. „Molekulinis mikroorganizmų atpažinimo mechanizmas žarnyno epitelinėse ląstelėse ir jo sąsaja su uždegiminių žarnų ligų etiopatogeneze“ Finansavimo šaltinis: Lietuvos valstybinis mokslo ir studijų fondas. Sąmatinė vertė: 40,000 Lt. Terminai: 2008.

    5. “Hemochromatozės geno HFE mutacijų c.845G>A (p.C282Y), c.187C>G (p.H63D) ir c.193A>T (p.S65C) paplitimas Lietuvos populiacijoje“. Finansavimo šaltinis: Lietuvos valstybinis mokslo ir studijų fondas. Sąmatinė vertė: 40,000 Lt. Terminai: 2009.

    6. “Aplinkos genetinių faktorių ir mikrofloros įtaka sistemos audinių ir organų funkcijai ir ligų etiopatogenezei”. Finansavimo šaltinis: Kauno medicinos universiteto Mokslo fondas. Sąmatinė vertė: 45,000 Lt. Terminai: 2006-2009.

    7. “Virškinimo trakto organų uždegimas: fundamentalūs etiologijos ir patogenezės aspektai bei diagnostikos ir gydymo optimizavimas“. Finansavimo šaltinis: Kauno medicinos universiteto Mokslo fondas. Sąmatinė vertė: 60,000 Lt. Terminai: 2007-2010.

     

    Tarptautiniai projektai:

    8. Bendras projektas su Taibėjaus ir Latvijos universitetais. Projekto pavadinimas: “Analysis of H.pylori virulence and host response factors in the development of atrophic gastritis in Baltic States and Taiwan (2007-2010)”. Finansavimo šaltinis: Baltijos šalių - Taivanio fondas. Sąmatinė vertė: 60,000 USD. Terminai: 2007-2010.

    9. Bendras projektas su Taibėjaus ir Latvijos universitetais. Projekto pavadinimas: “Serological detection of atrophic gastritis and its evolution following H.pylori eradication in areas with high prevalence of H.pylori infection”. Finansavimo šaltinis: Baltijos šalių - Taivanio fondas. Sąmatinė vertė: 60,000 USD. Terminai: 2004-2007.

    10. Bendras projektas su Kylio universitetu. Projekto pavadinimas: “Comparison of Bacterial Metagenomes between Countries with Low and High Incidence of Inflammatory Bowel Disease”. Finansavimo šaltinis: „International organization for study of inflammatory bowel disease“ (http://www.ioibd.org/grants.htm). Sąmatinė vertė: 70.000 USD. Terminai: 2006-2008. 

    11. International IBD Genetics Project (2011-2013).

    12. European ECCO-EpiCom epidemiology East-West IBD gradient project. (2010-2015).

  • Klinikinės ir molekulinės gastroenterologijos laboratorijos mokslinės publikacijos

    Straipsniai  ISI Web of Science duomenų  bazės žurnaluose su aukštu svorio koeficientu (IF >9.0).

    1. Jostins L, Ripke S, Weersma RK, Duerr RH, McGovern DP, Hui KY, Lee JC, Schumm LP, Sharma Y, Anderson CA, Essers J, Mitrovic M, Ning K, Cleynen I, Theatre E, Spain SL, Raychaudhuri S, Goyette P, Wei Z, Abraham C, Achkar JP, Ahmad T, Amininejad L, Ananthakrishnan AN, Andersen V, Andrews JM, Baidoo L, Balschun T, Bampton PA, Bitton A, Boucher G, Brand S, Büning C, Cohain A, Cichon S, D'Amato M, De Jong D, Devaney KL, Dubinsky M, Edwards C, Ellinghaus D, Ferguson LR, Franchimont D, Fransen K, Gearry R, Georges M, Gieger C, Glas J, Haritunians T, Hart A, Hawkey C, Hedl M, Hu X, Karlsen TH, Kupcinskas L, Kugathasan S, Latiano A, Laukens D, Lawrance IC, Lees CW, Louis E, Mahy G, Mansfield J, Morgan AR, Mowat C, Newman W, Palmieri O, Ponsioen CY, Potocnik U, Prescott NJ, Regueiro M, Rotter JI, Russell RK, Sanderson JD, Sans M, Satsangi J, Schreiber S, Simms LA, Sventoraityte J, Targan SR, Taylor KD, Tremelling M, Verspaget HW, De Vos M, Wijmenga C, Wilson DC, Winkelmann J, Xavier RJ, Zeissig S, Zhang B, Zhang CK, Zhao H; International IBD Genetics Consortium (IIBDGC), Silverberg MS, Annese V, Hakonarson H, Brant SR, Radford-Smith G, Mathew CG, Rioux JD, Schadt EE, Daly MJ, Franke A, Parkes M, Vermeire S, Barrett JC, Cho JH. Host-microbe interactions have shaped the genetic architecture of inflammatory bowel disease. Nature. 2012 Nov 1;491(7422):119-24. (IF- 36,1)
    2. Ellinghaus D, Zhang H, Zeissig S, Lipinski S, Till A, Jiang T, Stade B, Bromberg Y, Ellinghaus E, Keller A, Rivas MA, Skieceviciene J, Doncheva NT, Liu X, Liu Q, Jiang F, Forster M, Mayr G, Albrecht M, Hasler R, Boehm BO, Goodall J, Berzuini CR, Lee J, Andersen V, Vogel U, Kupcinskas L, Kayser M, Krawczak M, Nikolaus S, Weersma RK, Ponsioen CY, Sans M, Wijmenga C, Strachan DP, McArdle WL, Vermeire S, Rutgeerts P, Sanderson JD, Mathew CG, Vatn MH, Wang J, Nothen MM, Duerr RH, Buning C, Brand S, Glas J, Winkelmann J, Illig T, Latiano A, Annese V, Halfvarson J, Damato M, Daly MJ, Nothnagel M, Karlsen TH, Subramani S, Rosenstiel P, Schreiber S, Parkes M, Franke A. Association Between Variants of PRDM1 and NDP52 and Crohns Disease, Based on Exome Sequencing and Functional Studies. Gastroenterology. 2013 Aug;145(2):339-47. (IF- 12,0)
    3. Burisch J, Pedersen N, Cukovic-Cavka S, Brinar M, Kaimakliotis I, Duricova D, Shonová O, Vind I, Avnstrøm S, Thorsgaard N, Andersen V, Krabbe S, Dahlerup JF, Salupere R, Nielsen KR, Olsen J, Manninen P, Collin P, Tsianos EV, Katsanos KH, Ladefoged K, Lakatos L, Björnsson E, Ragnarsson G, Bailey Y, Odes S, Schwartz D, Martinato M, Lupinacci G, Milla M, De Padova A, D'Incà R, Beltrami M, Kupcinskas L, Kiudelis G, Turcan S, Tighineanu O, Mihu I, Magro F, Barros LF, Goldis A, Lazar D, Belousova E, Nikulina I, Hernandez V, Martinez-Ares D, Almer S, Zhulina Y, Halfvarson J, Arebi N, Sebastian S, Lakatos PL, Langholz E, Munkholm P; for the EpiCom-group. East-West gradient in the incidence of inflammatory bowel disease in Europe: the ECCO-EpiCom inception cohort. Gut. 2013 Apr 20. [Epub ahead of print] (IF-9,0).
    4. Travis SP, Danese S, Kupcinskas L, Alexeeva O, D'Haens G, Gibson PR, Moro L, Jones R, Ballard ED, Masure J, Rossini M, Sandborn WJ. Once-daily budesonide MMX in active, mild-to-moderate ulcerative colitis: results from the randomised CORE II study.  Gut. 2013 Feb 22. [Epub ahead of print]. (IF-9,0).
    5. Lepage P, Häsler R, Spehlmann ME, Rehman A, Zvirbliene A, Begun A, Ott S, Kupcinskas L, Doré J, Raedler A, Schreiber S. Twin Study Indicates Loss of Interaction Between Microbiota and Mucosa of Patients With Ulcerative Colitis.  Gastroenterology.2011 Jul;141(1):227-36, (IF - 12.0)
    6. Anderson CA, Boucher G, Lees CW, Franke A, D'Amato M, Taylor KD, Lee JC, Goyette P, Imielinski M, Latiano A, Lagacé C, Scott R, Amininejad L, Bumpstead S, Baidoo L, Baldassano RN, Barclay M, Bayless TM, Brand S, Büning C, Colombel JF, Denson LA, De Vos M, Dubinsky M, Edwards C, Ellinghaus D, Fehrmann RS, Floyd JA, Florin T, Franchimont D, Franke L, Georges M, Glas J, Glazer NL, Guthery SL, Haritunians T, Hayward NK, Hugot JP, Jobin G, Laukens D, Lawrance I, Lémann M, Levine A, Libioulle C, Louis E, McGovern DP, Milla M, Montgomery GW, Morley KI, Mowat C, Ng A, Newman W, Ophoff RA, Papi L, Palmieri O, Peyrin-Biroulet L, Panés J, Phillips A, Prescott NJ, Proctor DD, Roberts R, Russell R, Rutgeerts P, Sanderson J, Sans M, Schumm P, Seibold F, Sharma Y, Simms LA, Seielstad M, Steinhart AH, Targan SR, van den Berg LH, Vatn M, Verspaget H, Walters T, Wijmenga C, Wilson DC, Westra HJ, Xavier RJ, Zhao ZZ, Ponsioen CY, Andersen V, Torkvist L, Gazouli M, Anagnou NP, Karlsen TH, Kupcinskas L, Sventoraityte J, Mansfield JC, Kugathasan S, Silverberg MS, Halfvarson J, Rotter JI, Mathew CG, Griffiths AM, Gearry R, Ahmad T, Brant SR, Chamaillard M, Satsangi J, Cho JH, Schreiber S, Daly MJ, Barrett JC, Parkes M, Annese V, Hakonarson H, Radford-Smith G, Duerr RH, Vermeire S, Weersma RK, Rioux JD. Meta-analysis identifies 29 additional ulcerative colitis risk loci, increasing the number of confirmed associations to 47. Nat Genet. 2011 Mar;43(3):246-52. (IF- 36,1)
    7. Franke A, Balschun T, Sina C, Ellinghaus D, Häsler R, Mayr G, Albrecht M, Wittig M, Buchert E, Nikolaus S, Gieger C, Wichmann HE, Sventoraityte J, Kupcinskas L, Onnie CM, Gazouli M, Anagnou NP, Strachan D, McArdle WL, Mathew CG, Rutgeerts P, Vermeire S, Vatn MH; IBSEN study group, Krawczak M, Rosenstiel P, Karlsen TH, Schreiber S.Genome-wide association study for ulcerative colitis identifies risk loci at 7q22 and 22q13 (IL17REL). Nat Genet. 2010 Apr;42(4):292-4. (IF- 36,1)
    8. Franke A, Balschun T, Karlsen TH, Sventoraityte J, Nikolaus S, Mayr G, Domingues FS, Albrecht M, Nothnagel M, Ellinghaus D, Sina C, Onnie CM, Weersma RK, Stokkers PC, Wijmenga C, Gazouli M, Strachan D, McArdle WL, Vermeire S, Rutgeerts P, Rosenstiel P, Krawczak M, Vatn MH; IBSEN study group, Mathew CG, Schreiber S. Sequence variants in IL10, ARPC2 and multiple other loci contribute to ulcerative colitis susceptibility. Nat Genet. 2008 Nov;40(11):1319-23
    9. Kondrackiene J., Beuers U., Kupcinskas L. "Efficacy and safety of ursodeoxycholic acid versus cholestyramine in intrahepatic cholestasis of pregnancy. Gastroenterology, 2005  Sep;129(3):894-901. (r  (IF - 13.0) .
    10. Stange EF, Travis SPL, Vermeire S, Beglinger C, Kupcinskas L, Geboes K, Barakauskiene A, Villanacci V, Von Herbay A, Warren BF, Gasche C, Tilg H, Schreiber S, Schölmerich J, Reinisch W. for the European Crohn's and Colitis Organisation (ECCO). European evidence-based consensus on the diagnosis and management of Crohn‘s disease: Definitions and diagnosis. Gut, 2006; 55 Suppl 1: i1-i15. (IF-9.0)

    Kiti straipsniai  ISI Web of Science duomenų  bazės žurnaluose  su  svorio koeficientu  (IF):

    1. Skieceviciene J, Kiudelis G, Ellinghaus E, Balschun T, Jonaitis LV, Zvirbliene A, Denapiene G, Leja M, Pranculiene G, Kalibatas V, Saadati H, Ellinghaus D, Andersen V, Valantinas J, Irnius A, Derovs A, Tamelis A, Schreiber S, Kupcinskas L, Franke A. Replication Study of Ulcerative Colitis Risk Loci in a Lithuanian-Latvian Case-Control Sample. Inflamm Bowel Dis. 2013 Oct;19(11):2349-2355.
    2. Kupcinskas J, Wex T, Bornschein J, Selgrad M, Leja M, Juozaityte E, Kiudelis G, Jonaitis L, Malfertheiner P. Lack of association between gene polymorphisms of Angiotensin converting enzyme, Nod-like receptor 1, Toll-like receptor 4, FAS/FASL and the presence of Helicobacter pylori-induced premalignant gastric lesions and gastric cancer in Caucasians. BMC Med Genet. 2011 Aug 24;12:112. (IF-2,4).
    3. Link A, Kupcinskas J, Wex T, Malfertheiner P. Macro-role of microRNA in gastric cancer. Dig Dis. 2012;30(3):255-67. (IF-2,7).
    4. Sonata Trumbeckaite, Irma Kuliaviene, Olegas Deduchovas, Marius Kincius, Rasa Baniene, Simona Virketyte, Dovidas Bukauskas, Eugene Jansen, Limas Kupčinskas, Vilmante Borutaite, Antanas Gulbinas.Experimental acute pancreatitis induces mitochondrial dysfunction in rat pancreas, kidney and lungs but not in liver  Pancreatology, 2013 May-Jun;13(3):216-24. (IF-2,0)
    5. Kuliaviene I, Gulbinas A, Cremers J, Pundzius J, Kupcinskas L, Dambrauskas Z, Jansen E. Fatty acids of erythrocyte membrane in acute pancreatitis patients. World J Gastroenterol. 2013 Sep 14;19(34):5678-84. (IF-2,4)
    6. Leja M, Funka K, Janciauskas D, Putnins V, Ruskule A, Kikuste I, Kojalo U, Tolmanis I, Misins J, Purmalis K, Pimanov S, Makarenko J, Kupcinskas L, Vikmanis U. Interobserver variation in assessment of gastric premalignant lesions: higher agreement for intestinal metaplasia than for atrophy. Eur J Gastroenterol Hepatol. 2013 Jun;25(6):694-699 (IF-1,7)
    7. Kiudelis G, Jonaitis L, Adamonis K, Žvirblienė A, Tamelis A, Kregždytė R, Kučinskienė R, Šventoraitytė J, Kupčinskas L. Incidence of inflammatory bowel disease in Kaunas region, Lithuania. Medicina (Kaunas). 2012;48(8):431-5.
    8. Kupcinskas L, Rasmussen L, Jonaitis L, Kiudelis G, Jørgensen M, Urbonaviciene N, Tamosiunas V, Kupcinskas J, Miciuleviciene J, Kadusevicius E, Berg D, Andersen LP. Evolution of Helicobacter pylori susceptibility to antibiotics during a 10-year period in Lithuania. APMIS. 2013 May;121(5):431-6. (IF-2,0).
    9. Mickevičius A, Endzinas Ž, Kiudelis M, Jonaitis L, Kupčinskas L, Pundzius J, Maleckas A. Influence of wrap length on the effectiveness of Nissen and Toupet fundoplications: 5-year results of prospective, randomized study. Surg Endosc. 2013 Mar;27(3):986-91. (IF-3,8)
    10. Agréus L, Kuipers EJ, Kupcinskas L, Malfertheiner P, Di Mario F, Leja M, Mahachai V, Yaron N, van Oijen M, Perez Perez G, Rugge M, Ronkainen J, Salaspuro M, Sipponen P, Sugano K, Sung J. Rationale in diagnosis and screening of atrophic gastritis with stomach-specific plasma biomarkers. Scand J Gastroenterol. 2012 Feb;47(2):136-47. (IF-1,7)
    11. Performance of routine Helicobacter pylori tests in patients with atrophic gastritis. Sudraba A, Daugule I, Rudzite D, Funka K, Tolmanis I, Engstrand L, Janciauskas D, Jonaitis L, Kiudelis G, Kupcinskas L, Ivanauskas A, Leja M.  J Gastrointestin Liver Dis. 2011 Dec;20(4):349-54.
    12. Jonaitis L, Kriukas D, Kiudelis G, Kupčinskas L.Risk factors for erosive esophagitis and Barrett's esophagus in a high Helicobacter pylori prevalence area. Medicina (Kaunas). 2011;47(8):434-9 (IF-0,4)
    13. Leja M, Kupcinskas L, Funka K, Sudraba A, Jonaitis L, Ivanauskas A, Janciauskas D, Kuidelis G, Chiu HM, Lin JT. Value of gastrin-17 in detecting antral atrophy. Adv Med Sci. 2011;56(2):145-50. (IF-1,0)
    14. Andersen V, Ernst A, Sventoraityte J, Kupcinskas L, Jacobsen BA, Krarup HB, Vogel U, Jonaitis L, Denapiene G, Kiudelis G, Balschun T, Franke A. Assessment of heterogeneity between European Populations: a Baltic and Danish replication case-control study of SNPs from a recent European ulcerative colitis genome wide association study. BMC Med Genet. 2011 Oct 13;12:139. doi: 10.1186/1471-2350-12-139.
    15. Kucinskas L, Juzenas S, Sventoraityte J, Cedaviciute R, Vitkauskiene A, Kalibatas V, Kondrackiene J, Kupcinskas L. Prevalence of C282Y, H63D, and S65C mutations in hereditary HFE-hemochromatosis gene in Lithuanian population. Ann Hematol. 2012 Apr;91(4):491-5.
    16. Mikhailova TL, Sishkova E, Poniewierka E, Zhidkov KP, Bakulin IG, Kupcinskas L, Lesniakowski K, Grinevich VB, Malecka-Panas E, Ardizzone S, D'Arienzo A, Valpiani D, Koch M, Denapiene G, Vago G, Fociani P, Zerbi P, Ceracchi M, Camerini R, Gasbarrini G. Randomised clinical trial: the efficacy and safety of propionyl-L-carnitine therapy in patients with ulcerative colitis receiving stable oral treatment. Aliment Pharmacol Ther. 2011 Nov;34(9):1088-97
    17. Kiudelis, M., Mickevicius, A., Maleckas, A., Endzinas, Z., Kiudelis, G., Jonaitis, L., & Kupčinskas, L. Laparoscopic myotomy or pneumatic dilatation for achalasia treatment?. Central European Journal of Medicine, 2011. 6(5), 640-644.
    18. Kupcinskas L, Wex T, Kupcinskas J, Leja M, Ivanauskas A, Jonaitis LV, Janciauskas D, Kiudelis G, Funka K, Sudraba A, Chiu HM, Lin JT, Malfertheiner P. Interleukin-1B and interleukin-1 receptor antagonist gene polymorphisms are not associated with premalignant gastric conditions: a combined haplotype analysis. Eur J Gastroenterol Hepatol. 2010 ;22(10):1189-95. (IF-1.66)
    19. Kupcinskas L, Malfertheiner P. Helicobacter pylori and non-malignant diseases. Helicobacter. 2005;10 Suppl 1:26-33. (IF-2.0)
    20. Kupcinskas L, Lafolie P, Lignell A, Kiudelis G, Jonaitis L, Adamonis K, Andersen LP, Wadström T.  Phytomedicine, 2008 Jun;15(6-7):391-9 (IF-2.330)
    21. Van Assche G, Dignass A, Panes J, Beaugerie L, Karagiannis J, Allez M, Ochsenkühn T, Orchard T, Rogler G, Louis E, Kupcinskas L, Mantzaris G, Travis S, Stange E; European Crohn's and Colitis Organisation (ECCO). The second European evidence-based Consensus on  the diagnosis and management of Crohn's disease:  Definitions and dzagnosis. J Crohn's Colitis, 2010, 4: 7–27; (IF-2.6).
    22. EF Stange, SPL Travis, K Geboes, S Vermeire, W Reinisch, A Barakauskiene, R Feakins, JF Fléjou, H Herfarth, D Hommes, L Kupcinskas, P Lakatos, G Mantzaris, S Schreiber, M Stolte, V Villanacci, BF Warren. European Evidence-based nonsensus. the diagnosis and management of Ulcerative colitis: definitions and diagnosis. J Crohn‘s Colitis.  2008, 2, 1–23. (IF -2.6)
    23. Häsler R, Begun A, Freitag-Wolf S, Kerick M, Mah N, Zvirbliene A, Spehlmann ME, von Wurmb-Schwark N, Kupcinskas L, Rosenstiel P, Schreiber S. Genetic control of global gene expression levels in the intestinal mucosa - a human twin study.  Physiol Genomics2009, 10;38(1):73-9 (IF-3.4).
    24. Ivanauskas A, Hoffmann J, Jonaitis LV, Markelis R, Juozaityte E, Kupcinskas L, Lofton-Day C, Röcken C, Malfertheiner P. Distinct TPEF/HPP1 gene methylation patterns in gastric cancer indicate a field effect in gastric carcinogenesis. Dig Liver Dis. 2008; 40(12):920-6. (IF-2.0).
    25. Leja M, Kupcinskas L, Funka K, Sudraba A, Jonaitis L, Ivanauskas A, Janciauskas D, Kiudelis G, Chiu HM, Lin JT. The Validity of a Biomarker Method for Indirect Detection of Gastric Mucosal Atrophy Versus Standard Histopathology. Dig Dis Sci. 2009 Nov;54(11):2377-84.
    26. Kupcinskas L, Jonaitis L, Kiudelis G. A 1 year follow-up study of the consequences of Helicobacter pylori eradication in duodenal ulcer patients: unchanged frequency of erosive oesophagitis and decreased prevalence of non-erosive gastro-oesophageal reflux disease Eur J Gastroenterol Hepatol. 2004 Apr;16(4):369-74. (IF-1.8)
    27. Jonaitis LV, Kiudelis G, Kupcinskas L. Characteristics of patients with erosive and nonerosive GERD in high-Helicobacter-pyloriprevalence region. Dis Esophagus. 2004;17(3):223-7 (IF-0.8)
    28. Dailidiene D, Bertoli MT, Miciuleviciene J, Mukhopadhyay AK, Dailide G, Pascasio MA, Kupcinskas L, Berg DE. Emergence of tetracycline resistance in Helicobacter pylori: multiple mutational changes in 16S ribosomal DNA and other genetic loci. Antimicrob Agents Chemother. 2002 Dec;46(12):3940-6. (IF-4.5)
    29. Boyanova L, Mentis A, Gubina M, Rozynek E, Gosciniak G, Kalenic S, Goral V, Kupcinskas L, Kantarceken B, A, Archimandritis A, Dzierzanowska D, Vcev A, Ivanova K, Marina M, Mitov I, Aydin Petrov P, Ozden A, Popova M. The status of antimicrobial resistance of Helicobacter pylori in eastern Europe. Clin Microbiol Infect 2002 Jul;8(7):388-96. (IF-2.0)
    30. Sventoraityte J, Zvirbliene A, Franke A, Kwiatkowski R, Kiudelis G, Kupcinskas L, Schreiber S.  NOD2, IL23R and ATG16L1 polymorphismsin Lithuanian patients with inflammatory bowel disease. World J Gastroenterol, 2010 16(3): 358-363 (IF -2,1).
    31. Gross V, Bar-Meir S, Lavy A, Mickisch O, Tulassay Z, Pronai L, Kupcinskas L, Kiudelis G. Pokrotnieks J, Kovac A,  Faszczyk M,. Razbadauskas A Margus B, Stolte M,  Müller R, Greinwald R.  and the International Budesonide Foam Study Group. Budesonide foam  vs.budesonide enema in active ulcerative proctitis and proctosigmoidaitis. Aliment Pharmacol Ther. 2006;  23, 303–312. (IF-3.4)
    32. R. Eliakim, Z. Tulassay, L. Kupcinskas, K. Adamonis, J. Pokrotnieks, S. Bar-Meir, A. Lavy, R. Mueller, R. Greinwald, I. Chermes, V. Gross, on behalf of the International Salofalk® Foam Study Group Randomized, controlled clinical study comparing the efficacy and safety of a low-volume versus a high-volume mesalamine foam in active distal ulcerative colitis.  Aliment Pharmacol Ther, 2007, 26, 1237–1249. (IF-3.4)
    33. Kucinskas L, Jeroch J, Vitkauskiene A, Sakalauskas R, Petrenkiene V, Kucinskas V, Naginiene R, Schmidt H, Kupcinskas L. High frequency of the c.3207C>A (p.H1069Q) mutation in ATP7B gene of Lithuanian patients with hepatic presentation of Wilson’s disease. World J Gastroenterol 2008 October 14; 14(38): 5876-9. (IF-2.1).
    34. C. van Rensburg, A.N. Barkun, I. Racz, R. Fedorak, P. C. Borman, C. Berlinger, J. Balanzo, J. Deviere, L. Kupcinskas, R. Luehmann, H. Doerfler, S. Schafer-Preuss. Intravenous pantoprazole versus ranitidine for the prevention of peptic ulcer rebleeding: a multicenter, multinational, randomized trial  Aliment Pharmacol Ther. 2009; 29, 497–07 ( IF-3.4);
    35. Kondrackiene J, Kupcinskas L. Intrahepatic cholestasis of pregnancy - current achievements and unsolved problems World J Gastroenterol 2008; 14(38): 5781-8 (IF-2,1)
    36. Pribuisiene R, Uloza V, Kupcinskas L, Jonaitis L. Perceptual and Acoustic Characteristics of Voice Changes in Reflux Laryngitis Patients. J Voice. 2006, 20 (1):  128-136. (IF-0.8)
    37. Kupcinskas L,  Petrauskas D., Petrenkiene V, Katkus K. Prevalence of chronic virus hepatitis B and risk factors for hepatitis B virus among Lithuanian Army soldiers. Military medicine, 2007, Volume 172, Number 6, June 2007, 625-627. (IF-1,0)
    38. Kupcinskas L. Chronic Hepatitis in West and East. Dig Dis. 2007;25 (3) 25:274–276. (IF-1.5).
    39. Janulaityte-Günther D, Kupcinskas L, Pavilonis A, Valuckas K, Wadström T, Andersen LP. Combined serum IgG response to Helicobacter pylori VacA and CagA predicts gastric cancer. FEMS Immunol Med Microbiol. 2007 Jul;50(2):220-5. (IF-1.8)
    40. Andersen LP, Holck S, Kupcinskas L, Kiudelis G, Jonaitis L, Janciauskas D, Permin H, Wadström T. Gastric inflammatory markers and interleukins in patients with functional dyspepsia treated with astaxanthin. FEMS Immunol Med Microbiol. 2007 Jul;50(2):244-8. (IF-1.8)
    41. Andersen LP, Holck S, Janulaityte-Günther D, Kupcinskas L, Kiudelis G, Jonaitis L, Janciauskas D, Holck P, Bennedsen M, Permin H, Norn S, Wadström T. Gastric inflammatory markers and interleukins in patients with functional dyspepsia, with and without Helicobacter pylori infection. FEMS Immunol Med Microbiol. 2005 May 1;44(2):233-8. (IF-1.8)
    42. Janulaityte-Gunther D, Kucinskiene R, Kupcinskas L, Pavilonis A, Labanauskas L, Cizauskas A, Schmidt U, Wadström T, Andersen LP. The humoral immuneresponse to Helicobacter pylori infection in children with gastrointestinal symptoms. FEMS Immunol Med Microbiol. 2005 May 1;44(2):205-12. (IF-1.8)
    43. Jonaitis L Pribuisiene R, Kupcinskas L, Uloza V. Larhyngoscopic examination is superior endoscopy in patients with laryngeal form of gastroesophageal reflux disease. Scand J.Gastroenterol. 2006, 41: 131-137. (IF-1.8) 
    44. Kaspari S, Kupcinskas L., Heinze H., Berghöfer P. Pantoprazole 20 mg on-demand is effective in the long-term management  of patients with mild GERD. Eur J Gastroenterol Hepatol. 2005 Sep;17(9):935-41. (IF-1.8)
    45. Mickevicius A, Endzinas Z, Kiudelis M, Jonaitis L, Kupcinskas L, Maleckas A, Pundzius J. Influence of wrap lenth on efecctivesnes of Nisen and Touplet fundoaplications. A prospective randomised study. Surgical endoscopy.  2008;22(10):2269-76. (IF-3.2)
    46. Daugule I, Sudraba A, Chiu HM, Funka K, Ivanauskas A, Janciauskas D, Jonaitis L, Kiudelis G, Tolmanis I, Vanags A, Lin JT, Kupcinskas L, Leja M. Gastric plasma biomarkers and Operative Link for Gastritis Assessment gastritis stage.. Eur J Gastroenterol Hepatol. 2011 Apr;23(4):302-7. (IF-1,7)
    47. Gross V, Bunganic I, Belousova EA, Mikhailova TL, Kupcinskas L, Kiudelis G, Tulassay Z, Gabalec L, Dorofeyev AE, Derova J, Dilger K, Greinwald R, Mueller R; International BUC-57 Study Group. 3g mesalazine granules are superior to 9mg budesonide for achieving remission in active ulcerative colitis: a double-blind, double-dummy, randomised trial. J Crohns Colitis. 2011 Apr;5(2):129-38. (IF-2,7)
    48. Sumskiene J, Janciauskas D, Pilkauskaite G, Kristalnyj V, Kupcinskas L.  An unusual case of bleeding from stomach due to a giant diospyrobezoar.  Medicina (Kaunas). 2009;45(6):476-9. (IF-0,506)
    49. Silkauskaitė V, Pranculis A, Mitraitė D, Jonaitis L, Petrenkienė V, Kupčinskas L. Hepatic venous pressure gradient measurement in patients with liver cirrhosis: a correlation with disease severity and variceal bleeding. Medicina (Kaunas). 2009;45(1):8-13. (IF-0,506).
    50. Jonaitis L, Kupčinskas J, Kiudelis G, Kupčinskas L. De novo erosive esophagitis in duodenal ulcer patients related to pre-existing reflux symptoms, smoking, and patient age, but not to Helicobacter pylori eradication: a one-year follow-up study. Medicina (Kaunas). 2010;46(7):454-9. (IF-0,5)
  • Chirurginės gastroenterologijos laboratorija

    Laboratorijos vedėjas prof. Antanas Gulbinas

     

     

     

     

     

     

     

     

    Tel. (8 37) 326983
    El. paštas:  gulbanta@yahoo.com

    LSMU Virškinimo sistemos tyrimų instituto Chirurginės gastroenterologijos laboratorija glaudžiai bendradarbiauja su LSMU Chirurgijos klinika ir yra jos  funkcinis mokslo  padalinys. Laboratorijos misija: Virškinimo sistemos navikinių bei uždegiminių ligų molekulinių bei klinikinių tyrimų vykdymas ir plėtra. Laboratorijoje dirba patyrę mokslininkai, įvaldę reikiamą aparatūrą baltymų ekspresijos, epigenetinių mechanizmų tyrimams ir iRNR lygio genų ekspresijos tyrimams, ląstelių kultūrų eksperimentams.

    Chirurginės gastroenterologijos laboratorijos pagrindinės mokslinių tyrimų kryptys:

    • Virškinimo sistemos navikinių ligų  patogenezės ypatumų, komplikacijų ir gydymo taktikos įtaka ligos eigai ir išeitims.
    • Ūminio ir lėtinio pankreatitų  patogenezės ypatumų, komplikacijų ir gydymo taktikos įtaka ligos eigai ir  išeitims. (Eksperimentiniai ir klinikiniai tyrimai).
  • Chirurginės gastroenterologijos laboratorijos moksliniai projektai

    VMSF ir LMT finansuoti projektai

    1)      2005-2006 m. vykdytas VMSF finansuojamas Prioritetinių mokslo krypčių plėtros projektas “NAVIKAS”.

    2)      2007-2009 m. vykdytas VMSF Fondo inicijuojamų programų projektas “Biologinio atsako į radiodažninės abliacijos terminį poveikį tyrimas ir kompiuterinis modeliavimas” (Nr. P-02/2007).

    3)      2012-2014 m. vykdomas projektas LMT Lėtinių neinfekcinių ligų programos finansuojamas  ,, Kasos žvaigždinių ląstelių aktyvumo ir redokso būsenos tyrimai“ (LIG 12/2012).

    4)      Nuo 2013 m. vykdomas projektas finansuojamas Žmogiškųjų išteklių plėtros veiksmų programos ,,Kasos adenokarcinomos rezistentiškumo apoptezei ir chemoterapijai energetiniai, genetiniai ir epigenetiniai mechanizmai“ VP1-3.1-ŠMM-07-K-02-062.

     

    Kiti projektai

    5)      Genų reguliuojančių uždegiminį atsaką ir leukocitų adheziją ekspresijos tyrimas bei uždegimą moduliuojančių molekulių aktyvumo įvertinimas ūminio pankreatito metu.

    6)      Protekcinio geno HO-1 polimorfizmo įtakos ūminio pankreatito eigai ir išeitims tyrimas.

    7)      Oksidacinio streso molekulių ekspresijos pakitimų ūminio pankreatito metu bei kalcio signalų ir mitochondrijų funkcijos sutrikimų ūminio pankreatito metu tyrimai.

    8)      Epigenetinių pakitimų, sergant kasos, skrandžio ir periampuliniu vėžiu tyrimai (tumoro supresinių genų DNR hipermetilinimo tyrimas; genomo pasikartojančių nukleotidų sekų DNR hipometilinimo tyrimas; DNR metiltransferazės polimorfizmo reikšmės vėžio patogenezėje tyrimas.)

    9)      CUGBP2 reikšmės kasos, skrandžio vėžio patogenezėje bei šių pakitimų santykio su Cox-2 grandine tyrimai.

    10)   Uždegiminio antisekrecinio faktoriaus AF įtakos mažinant uždegiminį procesą bei sąaugų susidarymą eksperimentinio peritonito sąlygomis tyrimas. 

  • Chirurginės gastroenterologijos laboratorijos darbuotojų publikacijos
  • Kontaktai